Human LTR-retrotransposon families

Human LTR-retrotransposon family information

» TNT/TFBS+ in HERVs » Overall TFBS Statistics » HERV Families TFBS Statistics » TFBS Types Statistics

Please choose HERV family:

Current HERV family: MamGypLTR1a

Divergence Range TFBS+ in range TFBS in range (TNT) HERVs in Range (ALL) TNT / ALL TFBS+ / ALL
130 0 0 2 0.0000 0.0000
140 0 0 1 0.0000 0.0000
150 1 1 2 0.5000 0.5000
160 0 0 4 0.0000 0.0000
170 0 0 4 0.0000 0.0000
180 1 7 9 0.7778 0.1111
190 4 15 13 1.1538 0.3077
200 0 0 4 0.0000 0.0000
210 1 2 14 0.1429 0.0714
220 1 1 17 0.0588 0.0588
230 4 7 32 0.2188 0.1250
240 3 15 32 0.4688 0.0938
250 2 2 43 0.0465 0.0465
260 4 9 51 0.1765 0.0784
270 15 49 85 0.5765 0.1765
280 13 33 98 0.3367 0.1327
290 18 36 86 0.4186 0.2093
300 10 23 96 0.2396 0.1042
310 12 45 94 0.4787 0.1277
320 13 50 85 0.5882 0.1529
330 12 50 90 0.5556 0.1333
340 9 15 95 0.1579 0.0947
350 5 16 60 0.2667 0.0833
360 4 4 24 0.1667 0.1667
370 3 7 16 0.4375 0.1875
380 1 2 18 0.1111 0.0556
390 2 2 10 0.2000 0.2000
400 0 0 3 0.0000 0.0000
410 0 0 1 0.0000 0.0000
420 0 0 2 0.0000 0.0000

Divergence Range	TFBS+ in range	TFBS in range (TNT)	HERVs in Range (ALL)	TNT / ALL	TFBS+ / ALL
130	0	0	2	0.0000	0.0000
140	0	0	1	0.0000	0.0000
150	1	1	2	0.5000	0.5000
160	0	0	4	0.0000	0.0000
170	0	0	4	0.0000	0.0000
180	1	7	9	0.7778	0.1111
190	4	15	13	1.1538	0.3077
200	0	0	4	0.0000	0.0000
210	1	2	14	0.1429	0.0714
220	1	1	17	0.0588	0.0588
230	4	7	32	0.2188	0.1250
240	3	15	32	0.4688	0.0938
250	2	2	43	0.0465	0.0465
260	4	9	51	0.1765	0.0784
270	15	49	85	0.5765	0.1765
280	13	33	98	0.3367	0.1327
290	18	36	86	0.4186	0.2093
300	10	23	96	0.2396	0.1042
310	12	45	94	0.4787	0.1277
320	13	50	85	0.5882	0.1529
330	12	50	90	0.5556	0.1333
340	9	15	95	0.1579	0.0947
350	5	16	60	0.2667	0.0833
360	4	4	24	0.1667	0.1667
370	3	7	16	0.4375	0.1875
380	1	2	18	0.1111	0.0556
390	2	2	10	0.2000	0.2000
400	0	0	3	0.0000	0.0000
410	0	0	1	0.0000	0.0000
420	0	0	2	0.0000	0.0000